תכנית בית ספר למנהיגות חינוכית של מכון מנדל למנהיגות נוסדה בירושלים בשנת 1991 בשיתוף עם משרד החינוך. זוהי תכנית דו-שנתית, ייחודית מבחינת היקפה, תכניה ואופי הלימוד.
מטרת בית ספר למנהיגות חינוכית היא לפתח ולטפח מנהיגים חינוכיים בעלי חזון והשפעה שיניעו ויובילו תהליכים לקידום החינוך בישראל.

עמיתי בית ספר למנהיגות חינוכית מביאים עימם ניסיון מקצועי וניהולי, ומתקבלים לתכנית משהוכרו כבעלי יכולת להניע תהליכים משמעותיים בעתיד. במהלך השנתיים, העמיתים מקבלים מלגת קיום חודשית המאפשרת להם להקדיש את זמנם ומרצם ללימוד בתכנית, לחשיבה מעמיקה ולתכנון.

בוגרי בית ספר למנהיגות חינוכית משמשים בתפקידי מפתח במסגרות חינוכיות וחברתיות למיניהן. הם מאיישים משרות בכירות במשרדי ממשלה, ברשויות מקומיות ובארגונים חינוכיים וחברתיים, מנהלים בתי ספר ומובילים יוזמות רבות בתחום החינוך.
הקשר בין מכון מנדל למנהיגות לבוגריו והקשרים הנטווים בין הבוגרים יוצרים מערכות של שיתוף פעולה המשפיעות על החינוך בישראל ומחדשות את פניו.